5 磷酸化亚磷酰胺 II,5' Phosphorylating Amidite II可用于分子生物学研究
一、物化性质
保存条件:避光、-20°C储存,避免反复冻融
英文名称:5' Phosphorylating Amidite II (O-DMT-2,2-di(ethoxycarbonyl)propan-1,3-diol)
中文名称:5‘ 磷酸化亚磷酰胺 II
CAS:171285-25-9
分子式:C39H51N2O9P
分子量:722.80
稀释:稀释至100 μmol/mL。
偶联时间:10分钟偶联。
规格标准:该试剂的纯度通常达到95%以上,规格包括1mg、5mg、10mg等,也可按需包装。
生产商信息:陕西新研博美生物科技有限公司
展开剩余70%二、功能结构与组成5' Phosphate Amidite (O-DMT-2,2'-sulfonyldiethanol) 是一种专用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺试剂,其化学名称为 2-[2-(4,4'-二甲氧基三苯甲氧基)乙基磺酰基]乙基-(2-氰乙基)-(N,N-二异丙基)-亚磷酰胺。
核心骨架:以 2,2'-磺酰基二乙醇 为基础结构,通过磺酰基(-SO₂-)连接两个乙醇单元。
保护基团:5'端修饰 4,4'-二甲氧基三苯甲基(DMT),用于在合成过程中保护羟基并实现定向偶联。
活性基团:
亚磷酰胺基团(-P(N(iPr)₂)):用于与核苷酸的3'-OH发生偶联反应,延伸寡核苷酸链。
氰乙基保护基(-OCH₂CH₂CN):防止亚磷酰胺氧化,并在合成后通过碱性处理去除。
三、应用场景分子生物学研究:
用于合成 5'-磷酸化寡核苷酸,作为连接酶(如T4 DNA连接酶)的底物,适用于基因克隆、片段连接和载体构建。
在 NGS建库 中制备带磷酸末端的接头序列,促进DNA片段与测序接头的连接。
功能核酸制备:
构建 核酶(Ribozyme)和脱氧核酶(DNAzyme),其催化活性中心依赖5'-磷酸基团。
用于制备荧光标记或化学修饰的探针,增强检测特异性。
四、关联试剂iFluor 680 酪胺(iFluor 680 Styramide)
* Alexa Fluor 680酪胺的优异替代品*
VIC Amidite;VIC phosphoramidite
Cyanine3 Amidite;Cy3 亚磷酰胺基团
5' Phosphorylating Amidite II,O-DMT-2,2-di(ethoxycarbonyl)propan-1,3-diol
359010-70-1;Aminophenyl fluorescein
APF;3'-(p-aminophenyl) fluorescein
Quasar 670 C6 T Amidite;Quasar 670 C6 T 亚磷酰胺
Streptavidin, Alexa Fluor680 conjugate
Alexa Fluor680 链霉亲和素偶联物
Deferoxamine-fitc;Deferoxamine-Fluorescein
(本文内容由陕西新研博美生物科技有限公司木南整理)
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